Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HelbQ6NVF4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HelbQ6NVF4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms