Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frem2Q6NVD0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frem2Q6NVD0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms