Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SphkapQ6NSW3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SphkapQ6NSW3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SphkapQ6NSW3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SphkapQ6NSW3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SphkapQ6NSW3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SphkapQ6NSW3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SphkapQ6NSW3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SphkapQ6NSW3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SphkapQ6NSW3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms