Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt39Q6IFX4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt39Q6IFX4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms