Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms