Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap20Q6IFT4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms