Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edrf1Q6GQV7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Edrf1Q6GQV7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms