Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scaf8Q6DID3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scaf8Q6DID3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms