Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6DFW0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6DFW0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6DFW0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Q6DFW0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6DFW0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6DFW0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6DFW0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6DFW0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6DFW0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6DFW0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6DFW0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms