Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV8

Vwde, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwdeQ6DFV8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VwdeQ6DFV8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VwdeQ6DFV8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms