Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rftn1Q6A0D4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms