Protein–RNA interactions for Protein: Q6A051

Atrnl1, Attractin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atrnl1Q6A051 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atrnl1Q6A051 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atrnl1Q6A051 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms