Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZX8

Ablim3, Actin-binding LIM protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ablim3Q69ZX8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ablim3Q69ZX8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ablim3Q69ZX8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms