Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Thsd7aQ69ZU6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Thsd7aQ69ZU6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms