Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ric1Q69ZJ7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ric1Q69ZJ7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms