Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntn4Q69Z26 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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