Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms