Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab3ipQ68EF0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3ipQ68EF0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms