Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CilpQ66K08 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CilpQ66K08 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CilpQ66K08 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CilpQ66K08 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CilpQ66K08 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CilpQ66K08 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CilpQ66K08 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CilpQ66K08 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CilpQ66K08 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CilpQ66K08 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CilpQ66K08 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CilpQ66K08 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CilpQ66K08 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CilpQ66K08 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CilpQ66K08 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CilpQ66K08 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms