Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf2Q64705 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms