Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprdQ64487 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms