Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms