Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf4Q64287 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf4Q64287 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf4Q64287 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf4Q64287 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf4Q64287 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf4Q64287 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf4Q64287 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf4Q64287 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf4Q64287 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf4Q64287 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf4Q64287 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf4Q64287 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf4Q64287 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf4Q64287 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf4Q64287 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf4Q64287 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf4Q64287 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf4Q64287 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms