Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pan3Q640Q5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pan3Q640Q5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms