Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Defa17Q64016 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
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Defa17Q64016 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa17Q64016 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms