Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a5Q63ZW6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms