Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vil1Q62468 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms