Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Vamp1Q62442 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms