Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufa4Q62425 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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