Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim28Q62318 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim28Q62318 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim28Q62318 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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