Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ss18Q62280 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ss18Q62280 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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