Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn9aQ62205 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms