Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd180Q62192 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd180Q62192 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd180Q62192 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd180Q62192 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd180Q62192 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd180Q62192 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd180Q62192 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd180Q62192 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd180Q62192 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd180Q62192 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd180Q62192 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd180Q62192 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd180Q62192 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd180Q62192 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd180Q62192 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd180Q62192 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cd180Q62192 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd180Q62192 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd180Q62192 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd180Q62192 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd180Q62192 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd180Q62192 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd180Q62192 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd180Q62192 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd180Q62192 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd180Q62192 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd180Q62192 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd180Q62192 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd180Q62192 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd180Q62192 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms