Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf1Q61999 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Odf1Q61999 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Odf1Q61999 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Odf1Q61999 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Odf1Q61999 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Odf1Q61999 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Odf1Q61999 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Odf1Q61999 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Odf1Q61999 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Odf1Q61999 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Odf1Q61999 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Odf1Q61999 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf1Q61999 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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