Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Lrrn1Q61809 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Lrrn1Q61809 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Lrrn1Q61809 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Lrrn1Q61809 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Lrrn1Q61809 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Lrrn1Q61809 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Lrrn1Q61809 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn1Q61809 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrn1Q61809 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrn1Q61809 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
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Lrrn1Q61809 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn1Q61809 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn1Q61809 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn1Q61809 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn1Q61809 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn1Q61809 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn1Q61809 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn1Q61809 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn1Q61809 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn1Q61809 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn1Q61809 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn1Q61809 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn1Q61809 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn1Q61809 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn1Q61809 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn1Q61809 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn1Q61809 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn1Q61809 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn1Q61809 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn1Q61809 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn1Q61809 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms