Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga6Q61739 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itga6Q61739 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms