Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itm2aQ61500 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itm2aQ61500 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itm2aQ61500 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Itm2aQ61500 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itm2aQ61500 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itm2aQ61500 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itm2aQ61500 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itm2aQ61500 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itm2aQ61500 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itm2aQ61500 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itm2aQ61500 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itm2aQ61500 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itm2aQ61500 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itm2aQ61500 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms