Protein–RNA interactions for Protein: Q61477

Nbl1, Neuroblastoma suppressor of tumorigenicity 1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbl1Q61477 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbl1Q61477 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbl1Q61477 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbl1Q61477 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbl1Q61477 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbl1Q61477 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbl1Q61477 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbl1Q61477 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbl1Q61477 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbl1Q61477 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nbl1Q61477 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms