Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Msi1Q61474 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msi1Q61474 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms