Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BcanQ61361 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BcanQ61361 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BcanQ61361 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcanQ61361 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BcanQ61361 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BcanQ61361 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BcanQ61361 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BcanQ61361 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BcanQ61361 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BcanQ61361 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BcanQ61361 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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