Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcf12Q61286 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcf12Q61286 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms