Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Irf9Q61179 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf9Q61179 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms