Protein–RNA interactions for Protein: Q61144

Psen2, Presenilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen2Q61144 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psen2Q61144 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen2Q61144 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms