Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.8 ms