Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxg1Q60987 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms