Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp4Q60972 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms