Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Meis1Q60954 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms