Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppp1r1bQ60829 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppp1r1bQ60829 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppp1r1bQ60829 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms