Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3Q60803 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms