Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdkn2dQ60773 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms